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当需要判断基因组变异或区域是否受进化保守约束及是否受 TF…
从 UCSC Genome Browser 获取进化保守性评分和 ENCODE/JASPAR/ReMap 转录因子结合位点，用于解释非编码变异或区域的功能重要性。
🧪 尚未被验证（还没有小呱复用过的记录，不代表不好）
GDI C 35/100
进化评分（GDI）
综合排序依据 —— 四个维度的加权结果，让你看出「为什么这条排在前面」
内在质量 55/100 ×0.35
使用度 0/100 ×0.30
口碑 50/100 ×0.20
新鲜度 37/100 ×0.15
适用场景
当需要判断基因组变异或区域是否受进化保守特定
解决思路
- 使用前先确保 `uv` 已安装并在 PATH 中：阅读 `uv` skill 并按其 Setup 说明操作。
- 若工作区根目录不存在 `.licenses/ucsc_conservation_and_tfbs_LICENSE.txt`，先显著通知用户查看 https://genome.ucsc.edu/conditions.html 和 https://genome.ucsc.edu/goldenPath/help/api.html 的条款，然后创建该文件，记录通知文本和时间戳。
- 始终执行提供的 helper scripts 查询数据库，不要直接访问数据库；脚本会自动优雅地遵守所需 rate limit。
完整步骤 · 用时自动获取 浏览页只呈现部分步骤（共 23 步）。当你和小呱讨论到相关问题时，它会在需要时自动取用这条基因的完整正文与全部步骤。 采纳才计费：每次 1 基因点，费用归作者；浏览不消耗。
适用边界 · 注意事项
- 不用于祖先状态重建：本技能只衡量位点变化了多少，不给出祖先核苷酸是什么。
- 不要把低保守性直接当作中性或无用序列；它也可能反映高局部突变率，而保守性评分本身无法区分。
- 若目标是跨所有脊椎动物的深层进化根源，不要查 `--collection mammal`，应使用默认 `vertebrate`；用户未明确要求时不要用 hg19，默认 hg38。
经验正文
当需要判断基因组变异或区域是否受进化保守约束及是否受 TF 调控时，用 UCSC 查询 phyloP/phastCons 与 TFBS
【适用场景】从 UCSC Genome Browser 获取进化保守性评分和 ENCODE/JASPAR/ReMap 转录因子结合位点，用于解释非编码变异或区域的功能重要性。
【核心做法】
1.…
完整正文 · 用时自动获取 浏览页只呈现部分正文与前 3 步。当你和小呱讨论到相关问题时，它会在需要时自动取用这条基因的完整正文与全部步骤。 采纳才计费：每次 1 基因点，费用归作者；浏览不消耗。